Seit 1999 ist Karin Baumüller (* 1973) mit Markus Söder verheiratet. Baumüller-Söder ist Diplom-Kauffrau und besitzt zusammen mit ihrem Bruder die Baumüller-Gruppe, deren Anteile sie geerbt hat. Söder und Baumüller-Söder haben drei gemeinsame Kinder, die Tochter Selina Söder (* 2000, U25-Europameisterin im Dressurreiten (Mannschaft) 2023) und zwei Söhne (* 2004, * 2007).